気象庁は、2016年9月のエルニーニョ監視速報を発表した。同庁では、エルニーニョ現象など熱帯域の海洋変動を監視するとともに、それらの実況と見通しに関する情報を「エルニーニョ監視速報」として毎月1回（10日頃に）発表している。今回の発表によると、2016年9月の実況は、ラニーニャ現象が発生しているとみられる。これは、エルニーニョ監視海域の海面水温が基準値より0.3℃低く、以下に示した太平洋赤道域の海洋と大気の状態から、予測されたもの。1）海面水温：中部で平年より低く、西部で平年より高い、2）海洋表層の水温：中部から東部にかけて平年より低い、3）太平洋赤道域の対流活動：日付変更線付近で平年より不活発、4）大気下層の東風（貿易風）：中部で平年より強い。今後の見通しとして、冬にかけては、平常の状態になる可能性もある（40%）が、ラニーニャ現象が続く可能性の方がより高い（60%）という。